不孕症中约10%～20%属免疫性不孕。不论精子、卵子、受精卵、性激素、促性腺激素以至精浆，都具有一定的抗原性而导致免疫反应，造成不孕。
免疫性不孕分为同种免疫、局部免疫和自身免疫3类。
同种免疫指男方的精子、精浆作为抗原，在女方体内产生抗体，使精子凝集或使精子失去活动力。在一般情况下，女性并不产生免疫反应，只有约15%～18%的不孕妇女体内有抗精子抗体存在。在女性经期或有子宫内膜炎等疾患时，子宫内膜有损伤或者肛门性交，精子及其抗原物质才易于进入血流而激发女性的免疫反应。
局部免疫是指有些不孕妇女的子宫颈粘膜及子宫内膜含有产生免疫球蛋白G和A的淋巴样细胞 ，子宫颈粘液内含有抗精子的免疫球蛋白G、A和M。故子宫颈及女性生殖道对精子具有局部免疫作用。
自身免疫是男性精子、精浆或女性卵子、生殖道分泌物、激素等溢出生殖道进入自身的周围组织，造成自己身体的免疫反应，在体内产生相应的抗体物质，影响精子的活力或卵泡成熟和排卵。有人研究证实，5%～9%的不育男性体内有抗精子抗体存在，其产生的原因可能是由于双侧输精管阻塞或结扎，或过去患有严重的生殖道感染所致。
细胞免疫因素也与男性不育症有关，一些不育者精液中白细胞增高，可能其产生的淋巴因子和巨噬细胞因子等可以影响精子运动，使精子活力下降，精子形态改变。女性体内抗性腺激素抗体和抗性腺激素受体的抗体可造成卵巢早衰、卵巢性闭经。子宫内膜异位症于月经周期中可产生分解物，由巨噬细胞系统消除，刺激抗体产生而造成自身免疫。
