1.[脑积水] 有许多脑积水或肾积水的情况，都会到了怀孕后期才逐渐产生。
2.[全盲] 胎儿在子宫内因为没有光线的刺激，因此不会睁开眼睛，所以无法诊断出先天全盲或小眼症的状况。
3.[听力] 在胎儿5～6个月大时，听力已有发育，但目前没有任何的检查方式可以得知胎儿是否有先天性听障的问题。
4.[先天性心脏病] 心脏的心房中隔(即卵圆孔)及动静脉导管都是在出生后才会逐渐关闭，在出生时可轻易诊断出的心脏病，却无法在出生前就得知。
5.[肠胃道阻塞]肠胃道的阻塞病变极少会出现在怀孕24周之前，因为胎儿在怀孕前期通常很少大口地吞进羊水。
6.[肢(指、趾)端异常]像是手脚内翻或外翻、多指(趾)、并指或指节缺失等异常状况，也因为胎儿常处于握拳状态而几乎无法由超声波确切诊断。
7.[侏儒症]有部分的侏儒症无法在早期诊断出来。因为胎儿在6～7个月大的时候，骨头的发育生长就会逐渐停止。
8.[先天性代谢异常]绝大部分的生化代谢异常疾病，如黏多醣症，要等到宝宝出生进食后，才会逐渐发病，也因此许多致死性的生化代谢异常在产前无法辨认，除非妈妈已生过类似疾病的宝宝。
